La epilepsia idiopática es un diagnóstico de exclusión. Se determina descartando cualquier otra causa mediante análisis de sangre completo, resonancia magnética (RM) y análisis del líquido cefalorraquídeo (LCR). Estas pruebas buscan tumores cerebrales, inflamaciones, infecciones, problemas metabólicos. Los videos caseros de las crisis ayudan enormemente a los veterinarios en esta fase diagnóstica. Cuando se descarta toda causa alternativa y siguen habiendo crisis recurrentes, entonces es epilepsia idiopática. El diagnóstico se construye por evidencia acumulativa.